De Wetenschappelijke Raad evalueert de kwaliteit van het onderzoek van het Vredesinstituut, geeft de Raad van Bestuur en het Wetenschappelijk Secretariaat advies over belangrijke trends inzake vrede en veiligheid en kan geraadpleegd worden voor het lopende onderzoek. De Wetenschappelijke Raad is samengesteld uit de voorzitter van de Raad van Bestuur, de directeur van het Vredesinstituut en acht binnen- en buitenlandse specialisten.

Alyson J.K. Bailes - Gastprofessor Internationale Betrekkingen aan de Universiteit van IJsland. Mevrouw Bailes is voorzitter van de Wetenschappelijke Raad.

Prof. Dr. John Groom - Emeritus Professor Internationale Betrekkingen aan de Universiteit van Kent.

Prof. Dr. Sven Biscop - Directeur van het Security & Global Governance Programme bij Egmont - Koninklijk Instituut voor Internationale Betrekkingen - en coördinator van de Hogere Studies Defensie en Veiligheid.

Prof. Dr. Mark Duffield - Professor 'Development Politics' aan de Universiteit van Bristol.

Prof. Dr. Elise Féron - Senior Lecturer in Internationale Conflictanalyse aan de Universiteit van Kent en de Brussels School of International Studies.

Prof. Dr. Wolfgang Wagner - Senior Lecturer aan het Departement Politieke Wetenschappen van de Vrije Universiteit Amsterdam (VU).

Prof. Dr. Elspeth Guild - Professor Europese Migratierecht aan de Universiteit van Nijmegen, en gastprofessor aan de London School of Economics and Political Science (LSE).

Prof. Dr. Antoon Vandevelde - Professor bij het Centrum voor Ethiek, Sociale en Politieke Filosofie en Decaan van het Hoger Instituut voor Wijsbegeerte van de KULeuven.